所以他把大臣的極諫理解對東南財閥的聲援，而對太監們的出格行徑，卻格外寬容之。每有大臣和太監作對，他一定會罰前者，保護後者，將此表明自己打擊東南豪族的決心。

當然萬曆也不是不知道自己在玩火，他也在極力爲自己的安全加碼。一方面，他準許派駐各省太監的坐支一部分稅金礦銀，招兵買馬，擴充實力，以備民。另一方面，他將衛擴充到萬人以上，全都裝備了最新式的火槍。

不過他也知道，真講起戰鬥力來，太監軍肯定沒法跟那些能征善戰的虎狼之師相比，所以萬曆一面加大了太監監軍的力度，不管是京營、邊軍、還是各省的衛戍部隊，都派駐了監軍太監，並賦予他們調軍隊，對軍生殺予奪的大權。另一方面，他強令全國二十七名總兵，都必須將家眷送往京城居住，何時卸任，何時才能團聚。

爲了化解軍隊的怨氣，保住他們的擁護，萬曆也將大量的財政收向軍費傾斜，還給軍們加進爵，賦予他們與文平起平坐的權力……總之一句話，一切爲了大局的穩定。他堅信只要一手有太監的力量，一手有軍隊的支持，就算局勢再壞，自己的江山也會穩如磐石。

至於現在黎民所的苦楚，國家呈現的末世景象，他倒很看得開，認爲大纔有大治，等到東南的豪族油盡燈枯，不再有不控制、危及王朝統治的恐怖私人財富時，文也了無本之木，自己再重新收拾局面，恢復到太祖建國時，那個以農爲本、閉關自守、君君臣臣的好時代……必須承認的是，萬曆有著常人難以企及的智慧，從小所的皇家教育，使他可以察覺到危及自己統治的問題，並迅速找到解決途徑。然而在順利解決掉權臣沈默之後，他也丟掉了耐心，變得狂妄自大起來，認爲只要自己去做，任何問題都能迎刃而解。

然而，設地的想一想，他也有著深切的無奈。經過三朝大臣的蠶食和杯葛，皇權已經被隔離在朝廷之外，他無法任命任何一名員，對政務的意見，也被他的大臣當作耳旁風。如果任由這種趨勢發展下去，也許下一代皇帝，就徹底了傀儡，甚至連生命都不保。

爲了祖宗的基業，爲了自己的皇權，萬曆皇帝朱翊鈞，不得不去和所有人作對——因爲在他看來，首先是所有人和他作對。他也不是沒想過採取緩和的方式——譬如扶植張四維、清楚閣中的反對派，以及提拔終於皇帝的員，然而一切的努力，都在龐大的僚集團的反擊下化爲泡影，辛苦抗爭數年，一切依然照舊。

所以他不得不採取激烈的手段，來野蠻的清除纏繞龍椅的藤蔓，作爲一名皇帝來說，這都是他天經地義的工作。

公平的說，他唯一的錯誤，就是任用太監來做這些事，他低估了太監的變態和瘋狂，也必將遭到最無的懲罰——比如發生在遙遠呂宋的起義。

然而，除了太監之外，已經被僚集團層層包圍的皇帝，又能信任誰呢？

是非功罪自有後人評說，當世的人們只能按照自己的思路，苦苦的掙扎下去，就連皇帝也不例外。