阿合馬仗勢欺人，貪得無厭，凡是看見老百姓近郊的田沃土，都肆意侵占，據為己有。他在朝廷裏買賣，行賄賄，在朝廷裏目中無人，自以為是，對政敵無打擊，引起了極大的公憤。

有一個朝廷警衛士秦長卿的人，為人正直，眼睛裏不進沙子，對阿合馬的罪惡行徑非常憤恨，慷慨激昂，向朝廷寫出報告，揭發阿合馬的各種罪惡行徑。但是他隻有勇氣，沒有謀略，被阿合馬知道消息後，立即予以逮捕，把他弄死在監獄裏。死得很冤枉。

十九年三月，元世祖忽必烈到上都度暑假去了，皇太子也跟隨著離開了京城。有一個人是益都軍區的軍，名王著，他向來疾惡如仇，正直無私，敢作敢為，心裏對阿合馬很不“冒”，非常憤恨，很想除之而後快，就在私下裏地鑄造了大銅錘，自己發誓要不惜一切代價，打碎阿合馬的腦袋。

當時皇帝父子已經離開京城，群龍無首，京城的社會狀況非常混。有一個妖僧名高和尚的人，混進軍隊中施行邪惡的妖。但是沒有應驗，非常失敗，大丟麵子，隻得灰溜溜地逃走了，你詭詐地號稱自己死去了，要殺死所有的徒弟，用欺騙眾人，在暗中逃跑而去，人們也不知道真相，隻得不了了之。

王著見機行事，暗中相互勾結，選擇戊寅的日子，欺騙公眾皇太子要返回京城作佛事，如今了八十多人，在深夜裏，神不知鬼不覺地進京城。第二派遣二個僧報告政務院，以皇太子的名義，命令他們準備祭祀佛祖的齋，政務院阿合馬等人，也被蒙在鼓裏，弄不清楚葫蘆裏究竟賣的什麽藥，隻得照辦，沒有作任何防衛準備。

到了中午的時候，王著又派遣崔長假傳命令，要求副總理張易派出許多軍隊，到夜間的時候，東宮門前集結，執行任務。張易也是一筋，沒有腦子，沒有察覺其中的虛假之，就命令指揮義帶領軍隊到那裏待命。

王著布置好軍隊，自己就若無其事地騎在高頭大馬上，去召見阿合馬，詭計多端地告訴他皇太子即將到來，命令省部級以上的員全部在集中皇宮前麵，等候召見。

阿合馬派遣的副歡察兒等人，騎著幾匹馬走出關去，向北剛行進了十多裏路，就遇到了眾多軍隊，假意太子認為他們不召自來，魯莽行事，非常無禮，予以全部殺死，搶奪了他們的馬匹，向南直接進了健德門，嚴加防衛。

深夜二鼓時刻，阿合馬不知其中的緣故，在氣也不敢出，更不敢詢問其中的緣由，隻得昏頭昏腦地來到東宮前麵，他的隨警衛被全部勒令下馬，隻有酷似太子的人騎在馬背上指揮人們的行，招呼省部級以上的到前麵去，嚴厲地責問了阿合馬幾聲，王著立即命令拖過去，在長袖子裏取出早就藏好的銅錘，使盡渾力量，在阿合馬的腦袋上，狠狠地敲擊下去，隻聽見啪的一聲，好似砸碎西瓜一般脆響，阿合馬的腦袋，腦漿飛濺，死於非命。隨即又招呼副總理郝禎上前麵去，用同樣的方法予以殺害。接著逮捕關押了副總理張惠。

事件突然暴發，猝不及防，那些在場的委員會、監察部、留守部隊的員，也是丈二尺的和尚，不著頭腦，弄不清楚究竟發生了什麽事。

部長張九思突然清醒過來，在皇宮裏厲聲疾呼，高喊其中有詐。留守軍隊司令博敦，看見事突變，當機立斷，手握大錘，立即衝上前去，猝不及防，把騎在馬背上的人打下馬來，命令手下士兵箭齊下，就像飛蝗一般，暴雨一樣傾瀉過去，那些叛軍隊士兵，爭相逃命，立即潰散，很多人不及逃命，當場束手就擒。高和尚等人見事不妙，立即逃竄，不知去向，王著也是一條好漢，麵對強敵，毫不畏懼，麵不改，而出，請求逮捕，接關押。

副總理也先帖木兒知道消息後，立即騎馬跑到元世祖那裏，把突發事變的經過報告了皇帝，當時那裏的駐軍司令察罕腦兒，聽了以，兩眼回圓睜，頭發倒立，非常震怒，立即率領軍隊，急如星火，當就趕到了上都。先帖木兒命令監察委員孛羅、司徒和禮霍孫、委員阿裏等人，立即向各地發布通告，要求各地派出軍隊，到大都續集，合力平定叛。

庚辰那，他們在高梁河捕獲了高和尚。辛巳那，孛羅等人到達了大都。壬午那，他們在刑場上，誅殺了叛發起人王著、高和尚，用刀把他們無地砍了醬，並殺害了張易。

王著在刑場上，知道自己消滅阿合馬的目的已經達到，心裏非常痛快，臨刑時他大聲高呼：“我王著見義勇為，為下除害，今死了，毫不後悔，以後必定有人記錄這一重大曆史事件，讓我青史留名，流芳百世，永垂不朽，我死得其所，死而無憾！”

阿合馬死後，元世祖也還一直蒙在鼓裏，並不完全知道他的謀詭計，詐之，他命令監察部員責問阿合馬的妻子，了解到了許多況。

等到皇帝詳細地詢問到孛羅的時候，才完全知道了阿合馬所犯下的所有滔罪行，那時他才真相大白，如夢初醒，皇帝不大怒起來，高聲道：“王著殺阿合馬，殺得好，為民除害，我舉雙手讚！”

元世祖忽必烈為了發泄心中的怨氣，下令挖開阿合馬的墳墓，砍開棺材，把阿合馬碎萬段，無拋棄在通玄門外，讓群的野狗盡地吃完他的。那些飽欺的員和老百姓，看見碎了阿合馬集團，無不拍手稱快，奔走相告，敲鑼打鼓地熱烈慶賀。

阿合馬集團被消滅後，朝廷斬草除，他的兒子侄子也被全部逮捕殺害，他的家產也被全部沒收沒。阿合馬的的老婆，有一個名引住的，為了活命，藏得很，躲藏在二個被煮的人皮櫃子中，兩隻耳朵都還存在，一個被閹割的太監掌管著櫃子上的鑰匙，打櫃子，把拖了出來，對進行嚴格審訊，也不知道是誰，早已嚇得昏了過去，失去了理智。

也許也是阿合馬榨取的民脂民膏太多，吃得太多，所以他迸濺出來，加倍予以償還，真是罪大惡極，罪有應得。那些叛黨又趁機殺死了中央高中書令郝鎮，拘捕了右丞張惠。頓時宮廷中大鬧起來，作一團，毫無秩序。

叛已經平定後，元世祖就返回燕京都城，還認為阿合馬等人是被冤枉殺死的，準備加以恤，真是是非顛倒，黑白混淆。樞副使孛羅，史書上也記載為博羅。他而出，竭力反對恤阿合馬的家人，還曆數阿合馬的罪狀，憤怒地大聲：“他真是該殺！完全該殺！他罪大惡極，死有餘辜。隻是難為了王著，他為民除害，死得冤枉。”

忽辛當時是江淮右丞，被逮捕以後，皇帝命令朝廷的大臣對他進行審訊，忽辛反駁他們：“你們曾經接過我家的錢財，怎麽有資格審問我所犯下的罪過？”後來到參知政事張雄飛審問忽辛的時候，他先詢問忽辛：“我也曾經接你們家的錢財沒有？”

忽辛回答沒有，張雄飛接著對他：“你如此來，我就有資格審問你了？”就審問清楚了忽辛的罪過，依法將他死。元世祖後來雙聽郝鎮黨羽的罪惡，也下令對他進行屠殺的懲罰。

另外還有右丞耿仁，與郝鎮一樣犯有同樣的罪過，把他關進監獄，判了死刑。其餘的犯罪分子，也一律罷免，予以嚴懲，並裁減了多餘的員七百一十四人，撤銷了府機構二百多所，通過這次大清洗，朝廷外總算整頓好了。